防抽薹夏秋季节露地种植的有机香菜，尽管不会因为苗期受低温影响而抽薹，但是却会因夏秋季节的长日照（条件）而抽薹，这就要求生产中选择耐抽薹的有机香菜品种。
防“红秆”有机香菜“红秆”，即有机香菜的茎叶部分由绿变红，降低了有机香菜的商品价值，收购价格减半。夏秋季节露地种植的有机香菜，其茎叶会受强光照射而变红，特别是在间苗过晚（株高超过8厘米）时。要想预防有机香菜出现“红秆”，一是早间苗，没间一次苗喷施一次新高脂膜，在生产中，以幼苗长至3厘米高间苗为宜，并保持间苗后的株距在2厘米左右；二是覆盖遮阳网，有条件的农户，可在播种后搭高80～100厘米的棚架，棚上覆盖一层遮阳网。
防雨水夏秋季节，雨水较多，对刚刚出苗后不久的有机香菜幼苗危害很大。大雨过后，再骤然转晴，极易导致有机香菜烂心。雨后接着轻浇一遍井水，量以不淹没幼苗为宜，可防有机香菜烂心。
