有机大蒜软腐病是细菌性侵染病害，病原物是胡萝卜软腐欧氏杆菌，主要通过土壤中病残体上的病原物进行再侵染。秋播有机大蒜从11月开始发病，田间地势低洼、降雨及浇水多、排水不良、田间湿度大处发病重，阴沟阳畦方式栽培的发病重，抗寒性差的大蒜品种发病重，播种过早及施化肥过多而年前生长过旺的发病重。综合防治应该从播种开始。
1.选用优良有机蒜种，以脱毒、抗病、无病虫蒜种最佳。
2.宜选择地势平坦、排灌方便、土壤有机质丰富、保肥水能力强、而且前茬为非葱蒜类土壤种植有机大蒜。并精细整地，做到上松下实，以阻隔病源和规避发病条件。
3.施足腐熟的以磷、钾肥为主的优质有机肥，提高植株的抗病能力，以减少生理性病害发生。
4.发病后及早防治。采用以上措施后，一般可防治大蒜软腐病的发生，若仍有发生的，要及时处理掉。
